Der albanische Nationalspieler wechselte im Sommer 2013 aus der eigenen Nachwuchsabteilung in die 1. Mannschaft des FC Basel 1893 und verlängerte im Mai 2014 seinen Profivertrag bei Schweizer Meister um drei Jahre bis Ende Juni 2017. Um in der höchsten Spielklasse der Schweiz mehr Spielpraxis zu erlangen wurde Aliji im Januar 2015 zum FC Vaduz ausgeliehen. 

Aufgrund einer Verletzung von Adama Traoré mussteder FCB reagieren und machte im September 2015 von einer Rücknahmeoption Gebrauch, die esihm erlaubte, Aliji ans Rheinknie zurückzuholen. Für den FCB stand er insgesamt 42 Mal im Einsatz und erzielte ein Tor.

Der FC Basel 1893 bedankt sich bei Aliji, der Mitglied des diesjährigen Kaders der EURO 2016 war, für seinen Einsatz für Rotblau und wünscht ihm für seine Zukunft lles

Gute.